Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 AL592528.1-201ENST00000380008 3466 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 ATP4A-201ENST00000262623 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 IDS-201ENST00000340855 7619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 PLEKHG4-202ENST00000379344 4513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 MROH7-204ENST00000409996 2977 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 NFASC-206ENST00000404076 5728 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 BCL2L11-218ENST00000615946 5026 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 BCL2L11-220ENST00000620862 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 VDR-208ENST00000550325 3925 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 LINC02202-201ENST00000499583 2664 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 NRP1-208ENST00000395995 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 LARP4B-201ENST00000316157 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 SEMA3F-206ENST00000434342 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 AGGF1-201ENST00000312916 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 ATP8B2-202ENST00000368489 5861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VAMP8Q9BV40 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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