Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms