Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF182Q8N6D2 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms