Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 KLF17-201ENST00000372299 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC004990.1-202ENST00000454234 1965 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 NHSL2-202ENST00000510661 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C16orf54Q6UWD8 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms