Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC7AQ5VTJ3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms