Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMPD1Q5SYB0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms