Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 RN7SL519P-201ENST00000497925 288 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 KLKB1-207ENST00000513864 2175 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC104024.2-201ENST00000562897 3077 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 NDRG1-229ENST00000537882 2975 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CRP-201ENST00000255030 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 KCTD1-206ENST00000579973 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 MTMR11-202ENST00000439741 2827 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 RN7SL819P-201ENST00000581896 270 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 GRIK2-202ENST00000358361 1981 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CPT1B-203ENST00000395650 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SLC4A1AP-201ENST00000326019 2959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ZNF571-206ENST00000593133 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms