Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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SP6Q3SY56 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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SP6Q3SY56 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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SP6Q3SY56 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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SP6Q3SY56 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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SP6Q3SY56 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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SP6Q3SY56 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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SP6Q3SY56 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SP6Q3SY56 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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