Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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RTN1Q16799 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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RTN1Q16799 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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RTN1Q16799 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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RTN1Q16799 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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