Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CLPPQ16740 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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