Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms