Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEUROD1Q13562 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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