Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM2Q13029 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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