Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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