Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL23P55773 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL23P55773 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL23P55773 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL23P55773 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL23P55773 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL23P55773 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL23P55773 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL23P55773 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL23P55773 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL23P55773 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms