Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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PGGT1BP53609 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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PGGT1BP53609 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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PGGT1BP53609 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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PGGT1BP53609 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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PGGT1BP53609 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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PGGT1BP53609 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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PGGT1BP53609 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
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PGGT1BP53609 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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PGGT1BP53609 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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PGGT1BP53609 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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PGGT1BP53609 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP53609 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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