Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms