Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPFP49454 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPFP49454 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPFP49454 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPFP49454 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPFP49454 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPFP49454 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPFP49454 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPFP49454 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPFP49454 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPFP49454 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPFP49454 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPFP49454 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPFP49454 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPFP49454 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPFP49454 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPFP49454 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPFP49454 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPFP49454 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPFP49454 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPFP49454 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPFP49454 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPFP49454 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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