Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms