Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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TSPOP30536 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TSPOP30536 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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