Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms