Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD58P19256 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD58P19256 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD58P19256 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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