Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PTPRAP18433 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PTPRAP18433 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PTPRAP18433 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PTPRAP18433 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PTPRAP18433 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PTPRAP18433 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PTPRAP18433 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRAP18433 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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