Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms