Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD6O43541 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms