Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GPA33Q99795 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms