Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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