Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms