Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms