Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

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Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HPS3Q969F9 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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