Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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