Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms