Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms