Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 2191 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRE2-205ENST00000594076 2193 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL359317.2-201ENST00000554898 1826 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP6-203ENST00000618025 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 EPS8L3-203ENST00000369805 2325 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRE2-206ENST00000594294 2325 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CHRNB1-202ENST00000536404 1623 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 XPC-201ENST00000285021 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms