Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.5 ms