Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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