Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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