Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ATRQ13535 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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