Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms