Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAPOLAP51003 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PAPOLAP51003 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PAPOLAP51003 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAPOLAP51003 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAPOLAP51003 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAPOLAP51003 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAPOLAP51003 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAPOLAP51003 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPOLAP51003 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPOLAP51003 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPOLAP51003 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPOLAP51003 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPOLAP51003 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPOLAP51003 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAPOLAP51003 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAPOLAP51003 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPOLAP51003 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms