Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MLH1P40692 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MLH1P40692 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MLH1P40692 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MLH1P40692 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MLH1P40692 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MLH1P40692 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MLH1P40692 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms