Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP1P32455 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP1P32455 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms