Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2AP24928 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms