Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACO1P21399 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACO1P21399 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACO1P21399 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACO1P21399 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACO1P21399 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACO1P21399 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACO1P21399 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms