Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTBP09497 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTBP09497 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms