Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms