Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FAN1Q9Y2M0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAN1Q9Y2M0 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms