Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APEX2Q9UBZ4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms