Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms