Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RRBP1Q9P2E9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms